“随着热带病毒向北蔓延 可视化潜在的新疫苗”

随着热带病从其历史故乡蔓延到包括欧洲和美国在内的新地区，搭载高性能云计算的英国研究者为了对抗最能抵抗治疗的疫苗，设计了罕见的接种疫苗方法。

科学家布里斯托尔大学和法国国家科学研究中心采用了未来的行动建议，即实验室产生的蛋白质分子可以传递给蚊子的基底孔肯雅病疫苗。 这个发现在本周刊登在科学进展杂志上的论文中发表，展示了这种蛋白质如何在温暖的温度下容易制造和保存几个星期，从而更容易在冷藏困难的地区运输。 大量生产也很容易，这是疾病向北传播的特征之一。

布里斯托尔大学的生物化学教授、论文作者之一imre berger说，样本非常稳定，可以在室温下输送。 设计的疫苗支架和运输系统涉及采用甲骨文高性能云计算技术由电镜扫描的低温冷冻样品构建详细的3d图像。 他说:“我们需要看看实际的工程文案。 这是为云量身定制的，因为每个图像都是并行解决的。

这项事业可能有助于阻止向一般地区外传播的热带病毒。

基肯雅人的名字来源于东非的麦康德语，表示因疼痛而弯腰走路与登革热有关，引起高温、关节痛、疲劳。 在适当的条件下，叮咬的老虎蚊子会传到人类身上。 虽然目前没有可用的治疗方法和疫苗，但是法国生物技术企业valneva在5月份报告了对120名美国健康志愿者进行基础孔肯雅热疫苗试验的前景。

该病是包括寨卡病毒在内的一系列疾病，以前最先在撒哈拉以南非洲、亚洲和印度发现，随着全球化和气候变暖，将感染的蚊子推送到正常范围的北侧，传到北半球。 十几年前在意大利北部没有去国外旅行过的村民中爆发了神秘的疾病，这表明了这就是基肯雅热。 这种病蔓延到佛罗里达州。 寨卡病毒也在美国爆发，年有很多病例，两年前在德克萨斯州也感染了。

深度冻结

为了开发名为addomer的候选疫苗，科学家合成了能够携带刺激抗原和病毒免疫反应的物质的类似于布干维尔和十二面分子的蛋白质。 《科学进展》论文通过实验发现，addomer模仿病毒在小鼠中的行为，引起免疫反应。 科学家的创新表明支架可以容纳数百种不同的表位，这是抗体在免疫反应中结合的目标。

该论文的共同作者和论文的共同作者弗雷德里克·加佐尼( frederic garzoni )只需要采用本地超级计算机集群，通过oracle cloud infrastructure实现蛋白质可视化是该分子设计的关键 imophoron的创始人，目的是将科学家的研究方法商业化。

addomer科学家将布里斯托尔大学低温电镜曝光的计算机生成的图像连接起来，研究了合成蛋白质的分子结构。 该装置将液氮样本快速冷冻至0℃以下的近200度，生成二维图像。 可以使用特殊的软件构建接近原子分辨率的3d图像。

布里斯托尔大学的研究软件工程研究员克里斯托弗·伍德斯说，蛋白质的商业原理与3d形状密切相关。 只要花217英镑(约270美元)在作为云服务提供的oracle cpu和gpu上，团队就解决了大量低温电镜图像生成了单一的3d结构。 他说，如果只是偶尔生成图像，在云中运行图像显然更便宜。

公共云计算在分子生物学、物理学和其他科学行业中正在推进以前流传的超级计算机的成长或替代。